Výber vhodného biocídu a konzervačnej látky si vyžaduje komplexné posúdenie viacerých faktorov. Primárnou úvahou je špecifický aplikačný scenár, keďže rôzne kontexty kladú na týchto agentov odlišné požiadavky.
Napríklad v náteroch na báze vody- je potrebné vybrať biocíd, ktorý vykazuje vynikajúcu rozpustnosť vo vode a je kompatibilný s vodnými systémami; naopak, pre nátery na báze oleja- sa vyžaduje produkt s vysokou rozpustnosťou v oleji. Pri výrobe obalových materiálov na potraviny je nevyhnutné voliť biocídy, ktoré spĺňajú hygienické normy potravín a nepoškodzujú ľudské zdravie. Pre určité priemyselné systémy cirkulačnej vody je potrebné vyhodnotiť potenciálny vplyv biocídu na kvalitu vody a integritu zariadenia.
Druhým faktorom, ktorý treba zvážiť, je biocídne spektrum; rôzne biocídy vykazujú rôzne stupne účinnosti proti rôznym typom mikroorganizmov. Niektoré biocídy vykazujú silnú účinnosť proti baktériám, ale sú menej účinné proti plesniam a kvasinkám, zatiaľ čo iné majú širokospektrálne biocídne vlastnosti, ktoré sú schopné súčasne inhibovať rast širokého spektra mikroorganizmov. Preto by sa mal vybrať biocíd so špecifickým spektrom, ktoré zodpovedá konkrétnym typom mikroorganizmov vyžadujúcich elimináciu. Okrem toho je kritickým faktorom stabilita; biocíd si musí zachovať robustnú stabilitu v rôznych podmienkach prostredia. Napríklad by si mal zachovať svoju biocídnu účinnosť aj pri vystavení vysokým teplotám, vysokej vlhkosti alebo silne kyslému či zásaditému prostrediu. Okrem toho sa musí vyhodnotiť jeho stabilita počas skladovania a aplikácie, aby sa zabránilo akejkoľvek strate biocídnej účinnosti v dôsledku rozkladu alebo degradácie.
Ďalším dôležitým aspektom je kompatibilita; biocíd musí byť kompatibilný s ostatnými zložkami v rámci systému výrobku, ktorý sa má chrániť, čím sa zabezpečí, že nenastanú žiadne nepriaznivé chemické reakcie, ktoré by mohli ohroziť výkon výrobku. V súvislosti s nátermi je napríklad nevyhnutné zabezpečiť, aby biocíd negatívne neovplyvnil kľúčové vlastnosti, ako je rýchlosť schnutia, lesk alebo priľnavosť. Napokon, náklady predstavujú významný faktor; pri prísnom dodržiavaní nevyhnutných požiadaviek na biocídne a konzervačné látky by sme mali uprednostniť výber nákladovo-efektívnych možností. Zároveň je potrebné vziať do úvahy aj celkové náklady na používanie-vrátane faktorov, ako je požadované dávkovanie a spôsoby aplikácie-.
